Nuevos datos genómicos amplían el árbol de la vida de la mosca de la fruta
El estudio de Stanford amplía el árbol de la vida de la mosca de la fruta con nuevos datos genómicos de 179 especies.
Un grupo de investigadores liderado por Bernard Kim, de la Universidad de Stanford en Estados Unidos, presentó un estudio en la revista PLOS Biology que llena importantes lagunas en el árbol de la vida de la mosca de la fruta.
Las moscas de la fruta, con más de 4.400 especies, son organismos modelo en la investigación biológica y algunas de las primeras especies cuyo genoma completo fue secuenciado. Sin embargo, solo una pequeña fracción de estas especies cuenta con su genoma secuenciado, y la mayoría de las secuencias genómicas publicadas pertenecen a un conjunto limitado de especies con cepas endogámicas de laboratorio.
Para abordar esta limitación, los investigadores secuenciaron los genomas de 179 especies de moscas de la familia Drosophilidae, incluyendo moscas capturadas en la naturaleza, especímenes preservados en museos y cepas criadas en laboratorio. Utilizando un enfoque de secuenciación híbrido que combina tecnologías de lectura corta y larga, lograron producir secuencias genómicas de alta calidad y bajo costo a partir de material limitado.
Con estas nuevas secuencias y datos publicados previamente, produjeron un árbol filogenético para 360 especies de la familia Drosophilidae, afinando así la comprensión de las relaciones evolutivas entre estas especies. Además, alinearon casi 300 genomas de moscas de la fruta en una herramienta de código abierto para futuras investigaciones genómicas comparativas, como una alineación de genoma completo.
Este estudio demuestra que es posible secuenciar el genoma de organismos pequeños, como moscas individuales, incluso aquellas preservadas en museos durante dos décadas. Los autores del estudio concluyen que ahora es factible ensamblar genomas de cientos o miles de especies con el presupuesto de un solo laboratorio, lo que permitirá un nivel de resolución sin precedentes para estudiar la evolución en grupos diversos como las moscas de la fruta.
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