Атрибут rel="canonical" постоянно меняется с основного домена на субдомен и наоборот. А так же с основного домена на домен алиас и опять наоборот

Интернет-магазин.
Платформа: WordPress.
Количество страниц: 50.
Есть сайт: domen.site
На данном сайте стоит скрипт основные функции которого:
- Исключает прямой заход на сайт по ссылке.
- При заходе на сайта через поиск, вместо его основного доменного имени сайт открывается на алиасе: alias.site- Часть трафика с основного сайта вместо алиаса направляется на поддомен sub1.domen.siteСубдомен закрыт от индексации в файле роботс.

Проблема в том, что каким-то образом атрибут rel="canonical" постоянно меняется с основного домена на субдомен и наоборот. А так же с основного домена на домен алиас и опять наоборот.
Об этом постоянно сигнализирует Веб мастер.
ЗАДАЧА: найти причину этих постоянных изменений и сделать так чтобы данный атрибут был только у основного домена.