Компания вправе принять к вычету НДС с предоплаты даже без оригинала договора
Принимайте НДС к вычету с предоплаты, которую вы перечислили продавцу, даже если у вас нет оригинала договора и приложений к нему с условиями о предоплате (письмо Минфина от 18.05.2018 № 03-07-09/33573).